◆技术简介◆
染色质免疫沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation assay, CHIP)是目前研究体内蛋白质与 DNA相互作用的方法。 它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA 复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的DNA小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的 DNA 片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与 DNA 相互作用的信息。CHIP 不仅可以检测体内转录因子因子与 DNA 的动态作用,还可以用来研究组蛋白修饰与基因组的关系。
◆实验原理◆
在活细胞状态下,使用甲醛将蛋白质-DNA复合物进行固定使保持蛋白和 DNA 联合,并通过超声或酶切将染色质打断为一定范围内的小片段,随后用抗体特异性识别抗原,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段, IP过程中,目前多用精制的 prorein A 预先结合固化在 argarose 的 beads 上,使之与含有抗原的溶液 及抗体反应后,beads 上的 prorein A 就能吸附抗原达到精制的目的。
◆实验方法◆
①甲醛处理固定细胞收集细胞;
②对细胞进行裂解,并超声破碎DNA
③加入目的蛋白的抗体,与靶蛋白-DNA复合物相互结合;
④加入ProteinA,结合抗体-靶蛋白-DNA复合物;
⑤对沉淀下来的复合物进行清洗,除去一些非特异性结合;
⑥洗脱,得到富集的靶蛋白-DNA复合物;
⑦解交联,纯化富集的DNA片断;
⑧对分离得到的DNA片段进行PCR分析或者测序分析。
◆案例展示◆
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