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RT-qPCR检测
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◆技术简介◆


实时荧光定量PCR(real-time quantitativePCR),PCR反应体系中加入荧光染料SYBR或荧光标记的特异性探针,利用荧光信号的积累实时在线监控PCR反应过程,由于在PCR扩增基因的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据,可以实现对目的基因在样本中的相对定量或绝对定量。

荧光定量PCR不仅实现真正实现了绝对定量,而且具有灵敏度和特异性、高能实现多重反应、自动化程度高、无污染、实时和准确等特点。随着生物芯片技术和荧光探针定量技术的结合,实时荧光定量PCR在医学检测及其他各个领域中的应用前景十分广阔。

根据Real-time qPCR所使用荧光化学物质有荧光染料和荧光探针两类,根据使用荧光物质不同,该技术常用的方法有SYBR Green染料法和TaqMan探针法。


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◆实验方法◆


实验试剂、仪器和耗材


引物、TRIzol试剂、去基因组试剂、反转录试剂、PCR试剂、实时荧光定量PCR仪、96孔板


实验方法


1. 引物设计:根据目的基因序列分别设计特异性的引物或者荧光探针;


2. RNA抽提:提取各样本DNA/RNA、RNA反转录、跑电泳、测浓度;


3. 反转录:去基因组DNA,RNA反转录;


4. RealTime PCR(荧光定量PCR)扩增:配置PCR反应体系,加入模板、引物、染料和dNTP等体系所需的溶液;



5. 数据处理,进行扩增曲线、溶解曲线、表达量差异等分析。


数据处理方法


数据采用2-ΔΔCt法来计算。


为检测不同样本待测基因的表达差异,需要通过内参基因CT值来平衡这些实验差异,获得-CT值。即:检测基因CT值的平均数-内参基因CT值的平均数。

-CT=-Mean(检测基因CT值)-Mean(内参基因CT值)】 



对于两个样本间同一个检测基因表达量差异的计算公式为:


-△△CT=-(△CT样本1 -CT样本2=-【样本1(检测基因CT-内参基因CT)-【样本2(检测基因CT-内参基因CT)】。



结果展示


ACTIN-扩.pngACTIN溶.png
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◆实验类型◆



项目名称


内容

实验周期

价格

qPCR相对定量



① 引物设计

② RNA抽提反转录

③ 上机检测


2-3周

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qPCR绝对定量



① 标准曲线制备

② 引物设计

③ RNA抽提反转录

④ 上机检测


2-3周

点击询价





◆服务流程◆


项目服务流程.jpg






◆ 可检测样本类型 ◆


1. RNA样品

   提供的RNA总量不低于10ug,浓度不低于200ng/ul,尽量大于500ng/µlA260280应在1.8-2.0之间。需提供RNA质量检测图,变性凝胶电泳应呈现两条清晰的带。样本放入-80冰箱中贮存,干冰运输。 


2. 组织样品

    组织离体15分钟内,立即将其用消毒过的刀具切成黄豆大小(直径约0.5cm)的小块,PBS或生理盐水洗净血液、体液等影响实验结果的残留成分。随后将样本小块置于液氮中速冻,放入EP管中保存,再放入-80℃冰箱中或者液氮罐中保存,干冰运输。

 

3. 细胞

3.1 贴壁细胞

     吸净培养容器中的培养基,并加入PBS,用细胞铲将细胞刮入离心管中(或加入适量PBS清洗1次细胞后用胰酶消化细胞,加入血清终止反应后收集于离心管中),离心去掉上清,再加入PBS清洗细胞2次,离心后样本放入液氮或-80度冰箱中保存,细胞总量不低于107个。

如果要裂解样本,吸净培养容器中的培养基,并加入PBS洗几次后弃去PBS,加入适当体积的裂解液(依据裂解液说明书),用细胞铲将细胞刮入裂解液中。将细胞裂解液转移到样品管中。


3.2 悬浮细胞

     将细胞悬液转移至样品管中,离心弃掉上清。去除上清后用PBS清洗细胞2-3次,直至把所有的培养基去除干净;将离心后的细胞放入液氮或-80℃冰箱中保存。细胞总量不低于107

样本放入-80度冰箱中暂存。加入适当体积的裂解液(依据裂解液说明书)。反复吹吸直至清亮。

 

4. 细菌悬液

      将细菌悬液转移至样品管中离心,去除上清培养基,再用PBS清洗三次,清洗干净后,将菌体沉淀转移至1.5mlEP管中,封口膜封口,管子上做好标记,将样品放入-80℃冰箱中保存,干冰运输。

如果要裂解样本,加入适当体积的裂解液(依据裂解液说明书)。反复吹吸直至清亮。


5. 血液样品

5.1 全血

      采集新鲜血液放置抗凝管或血袋中保存,样本量大于2ml,需当天送达,4℃运输。或者新鲜血液分离白细胞,分离后的白细胞样本放入-80℃冰箱中保存,干冰运输。

如需提取RNA,建议采用专用的全血样品RNA提取试剂盒抽提RNA,如QIAamp RNA Blood Mini Kit


5.2 血清

      使用非抗凝管(或无热原无内毒素的离心管)采集血液样本,室温下静置1-3个小时不等或4℃静置过夜使其自然凝固,2000-3500/4℃低温离心10-20min,吸取收集上清,血清需要量为200ul,如量较多建议分装保存,避免反复冻融,-80℃冰箱中保存,干冰运输。

如需裂解样品,按每200uL血清加入1ml Trizol的比率加入足量Trizol,涡旋摇匀,放入-80℃冰箱保存,干冰运输。

 

5.3 血浆

     使用抗凝管(可根据样本选择EDTA、肝素钠、柠檬酸钠或枸橼酸纳作为抗凝剂)采集血液样本,混合10-20分钟后,2000-3000/4℃条件离心20分钟(或4000/分离心5min),仔细吸取收集上层液体,血清需要量为200ul,如量较多建议分装保存,避免反复冻融,-80℃冰箱中保存,干冰运输。

如需裂解样品,按每200uL血清加入1ml Trizol的比率加入足量Trizol,涡旋摇匀,放入-80℃冰箱保存,干冰运输。




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